Dirige el Grupo de Neurodegeneración y Envejecimiento en el Instituto de Investigaciones Biomédicas de Barcelona (IIBB) del CSIC y es miembro del CIBER de Epidemiología y Salud Pública. Su línea actual de estudio se centra en la investigación sobre pérdida cognitiva asociada al envejecimiento. José Luis Trejo dirige el Grupo de Neurogénesis del Individuo Adulto en el Instituto Cajal de Madrid (IC) del CSIC y es presidente del Consejo Español del Cerebro. Su investigación se centra en la conducta social y la herencia intergeneracional de los efectos beneficiosos del ejercicio para el cerebro y la cognición, y sus mecanismos epigenéticos.